第一册卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳发热潮热恶寒往来寒热外热内寒，外寒内热上热下寒，上寒下热疟厥第二册气郁痞水肿胀满积聚痰饮咳嗽喘短气第三册呕吐膈气呕吐反胃噎吐
卷一中风总括中风死候类中风总括伤风总括痉病总括痉病死证破伤风痹病总括周痹痹病生死证痹入脏腑证痿病总括痿痹辨似痿病治法香港脚总括香港脚死证卷二内伤总括内伤外感辨似虚劳总括虚劳死证虚劳治法痨瘵总括痨瘵治法
正文浮沉迟数滑涩人迎气口阳维阴维阳跷阴跷督任冲带附录运功规法南北规中引南旋式北旋式
传信适用方
医津一筏
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
新刻《儒门事亲》序重刊《儒门事亲》序《儒门事亲》后序卷一七方十剂绳墨订一指风痹痿厥近世差玄说二立诸时气解利禁忌式三疟非脾寒及鬼神辩四小儿疮丹瘾疹旧蔽记五证妇人带下赤白错分寒热解六霍乱吐泻死生如反掌说七
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
简介自序东洞先生著述书日记卷上卷中卷下跋《药征续编》序卷上卷下《药征续编》附录《药征续编》附言十七则
序一序二序三自序凡例卷之一伤寒门（四十三则）中寒门（七则）卷之二中风门（二十五则）痹证门（十一则）心痛门（六则）胁痛门（五则）头痛门（六则）腹痛门（六则）腰痛门（六则）卷之三咽喉痛门（七则）牙齿痛门（