序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
序谷菜瓜果味鸟兽鳞甲虫风寒暑湿燥气血痰虚实附录重刻大宗伯董玄宰先生秘传延寿丹方
脏腑虚实标本用药式
序自序自序杂症大小合参凡例（小引）杂症大小合参凡例痘疹全集凡例杂症痘疹药性主治合参凡例杂症大小合参卷首上 内经纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论
十问合阴阳天下至道谈胎产书杂禁方养生方却谷食气
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
自序一自序二卷上外症用刀针法火针不可轻用治筋缩法治足筋缩法浮皮兜脓须剪开升药所忌背部湿痰块痔漏疮鸡胸症龟背症虚人有病易昏愦病挟气郁宜审治少壮妇女病要法治孕妇病法时疫捷法（先看两肩有红点）产后治法大略温
鬼门十三针
简介水·火·土·金·石部草部木部果·米谷·菜·人部兽·虫鱼部用药凡例煎药则例·服药序次·服药禁忌妊娠服禁·六陈·十八反当禁不禁犯禁必死·不必忌而忌之过